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Taxonomie et phylogénie
Comment les organismes sont-ils classés?
- La taxonomie est le domaine de la biologie qui classe les organismes vivants et éteints selon un ensemble de règles. La taxonomie produit une hiérarchie de groupes dorganismes; les organismes sont affectés à des groupes en fonction des similitudes et des différences de leurs caractéristiques. Le système de classification commence par trois domaines qui englobent toutes les formes de vie vivantes et éteintes; les Bactéries et Archéens sont pour la plupart microscopiques, mais assez répandues. Le domaine Eukarya contient des organismes plus complexes; il est traditionnellement divisé en quatre royaumes , mais comprend désormais des « supergroupes » au-dessus du niveau du royaume (voir ci-dessous).
- Les relations évolutives dune espèce ou dun groupe despèces peuvent être utilisées pour construire des groupes taxonomiques; lhistoire évolutive dune espèce ou dun groupe despèces est appelée phylogénie. Un arbre phylogénétique est une hypothèse qui décrit les relations évolutives entre des groupes dorganismes; dans les arbres phylogénétiques détaillés, les points de ramification indiquent quand de nouvelles espèces ont divergé dun ancêtre commun. Les espèces (ou groupes despèces) et leur ancêtre commun le plus récent forment un clade au sein dun arbre phylogénétique. Les arbres phylogénétiques construits par des méthodes modernes peuvent décrire la relation entre les clades et les groupes taxonomiques .
Comment les arbres phylogénétiques sont-ils construits?
- Les arbres phylogénétiques sont généralement basés sur une homologie morphologique ou génétique . Une comparaison des traits anatomiques peut révéler une relation évolutive entre les espèces. Lanalyse des différences génétiques entre les espèces peut identifier la descendance dun gène ancestral. Les techniques génétiques modernes utilisent des « horloges moléculaires » pour aider à la construction darbres phylogénétiques.
- Les lapproche cladistique des arbres phylogénétiques met laccent sur les caractéristiques primitives et dérivées. Des caractéristiques partagées et dérivées sont utilisées pour construire un arbre appelé cladogramme . Déterminer lordre dapparition des caractéristiques au cours de lévolution peut être un défi.
Comment la systématique moléculaire change-t-elle notre vision de la taxonomie?
- La taxonomie est un travail en cours. À mesure que de nouvelles espèces sont découvertes, les groupes taxonomiques peuvent ne plus être monophylétiques . Lanalyse moléculaire des espèces a conduit à un réarrangement majeur des quatre royaumes traditionnels.
- Le processus de transfert horizontal de gènes conduit à « toiles de vie « plutôt que de simples arbres phylogénétiques; lévolution précoce des procaryotes peut avoir ressemblé à une toile de vie.
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Answer
La taxonomie est la description des espèces et des groupes plus importants, et la dénomination de ces espèces et groupes. La phylogénie est les relations – les lignes de descendance partagée – entre ces groupes.
La taxonomie est une description du présent; la phylogénie est une reconstruction du passé (les descriptions du présent sont, bien sûr, dune immense valeur pour déterminer la phylogénie).
La phylogénie est (une tentative de reconstruction, sous réserve de révision de) larbre de vie actuel ; la taxonomie est constituée des noms et des descriptions attachés aux branches.
Les révisions dans lune naffectent pas nécessairement lautre. Quand jétais jeune, les humains descendaient de reptiles; maintenant ils ne le sont pas. Il sagit dun changement taxonomique: «reptiles» ne signifie plus «tous les amniotes qui nont pas le sang chaud» et ninclut plus les amniotes de sang froid qui étaient nos ancêtres. Mais les positions de base des mammifères et des lézards sur larbre de vie – la phylogénie des amniotes – nont pas beaucoup changé.